Магния аспарагинат в медицине применяется как минеральная добавка с целью профилактики и лечения дефицита магния в организме и гипомагниемии.
Выделяют магния L-аспарагинат, магния D-аспарагинат и магния DL-аспарагинат, являющихся магниевыми солями L-, D- и DL-стереоизомеров аспаргиновой кислоты. В связи с тем, что биодоступность магния L-аспарагината выше, чем других стереоизомеров, то лекарственные препараты с L-стереоизомером магния аспарагината более эффективны, чем с D- и DL-стереоизомерами как при гипомагниеии, так и в отношении антиаритмической активности.