Les cellules des agents pathogènes sensibles à peuvent absorber la flucytosine (5-FC), ensuite métabolisée en 5-fluorouracile (5-FU) par l'intermédiaire d'une cytosine déaminase spécifique.
La quantité de 5-FU incorporée dans les acides ribonucléiques de l'agent pathogène est proportionnelle à la sensibilité de ce dernier.
Résistance possible en raison : De cas de résistance primaire.
Seule une étude in vitro de la souche en cause permet d'en évaluer la sensibilité.