В народной медицине масло мари амброзиевидной раньше применялось как противоглистное средство и для возбуждения аппетита, иногда как тонизирующее; в гомеопатии - при болезнях печени (желтухе), а также при инсульте.
В качестве лечебного сырья зачастую используют зеленые верхушки и плоды. Эти составляющие растения обладают довольно мощным слабительным, мочегонным и успокаивающим действием. При укусах ядовитых змей, например, гадюки, и насекомых определенные препараты показаны в качестве антисептика.